近未来，日本政要为了推进社会的发展，宣布正式开启提升智能机器人研究水平的“ARK计划”。

秉承着一颗正直之心的光明寺信彦博士参与其中，谁知相关负责人竟然假借“ARK计划”名义意图开发军用机器人。

在此之后，光明寺博士不明不白死于事故，身后留下了正上大学的女儿美津以及还未成年的儿子小胜。

某个夜晚，姐弟俩遭遇一伙不明身份之人的劫持，危机时刻一名神秘男子出手相助，随后该男子竟然现出战斗机器人的模样，他就是光明寺博士生前专门安装了良心回路的智能机器人次郎。

光明寺姐弟的命运由此和次郎搅到一起，而更大的危机和阴谋正向他们逼近……